Semnarea Pactului Molotov - Ribbentrop la 23 august 1939, prin care Germania nazistă și Uniunea Sovietică și-au împărțit zonele de influență în Europa, a condus la declanșarea celei mai mari și devastatoare conflagrații din istoria milenară a omenirii. Războiul Al Doilea Mondial a provocat moartea a peste 55 milioane de oameni, a lăsat în urma sa milioane de schilozi, orfani, văduve, a transformat în pulbere mii de orașe și sate, cauzând pierderi materiale incomensurabile.
Calvarul războiului nu a ocolit nici Moldova. Peste 110 mii de moldoveni-civili și ostași de pe câmpul de luptă - și-au pierdut viața. Sute și mii de sate, case de locuit, blocuri industriale, gospodării țărănești au fost șterse de pe fața pământului în timpul bombardamentelor și operațiunilor militare.
În perioada 20-29 august 1944, pământul moldav a devenit arena uneia dintre cele mai sângeroase operațiuni militare din anii celui de-Al Doilea Război Mondial - Operația Iași-Chișinău. În urma luptelor, teritoriul Moldovei a rămas acoperit cu morminte. Aici au îmbrăcat cămașa morții sute de mii de ostași, fii ai multor popoare, pe care războiul i-a purtat pe meleaguri străine. În perioada ce a urmat, peste 200 mii de basarabeni au fost mobilizați forțat în Armata sovietică și trimiși să lupte pe fronturile războiului. Unii dintre ei au ajuns cu luptele până la Königsberg, Berlin, pe teritoriul Coreii și al Japoniei militariste. Peste 50 de mii au căzut pe câmpul de luptă, rămânând să-și doarmă somnul veșnic pe meleaguri străine.
Expoziția „Memoria războiului. 1939-1945" reunește circa 280 de piese muzeale: fotografii, documente, uniforme militare, arme, obiecte personale ale participanților la război, scrisori de pe front, trofee de război, distincții, afișe de epocă, opere de artă și alte vestigii ce reconstituie aspecte dramatice din istoria celui de-Al Doilea Război Mondial.
Relicvele istorice evocă sacrificiul și eroismul manifestat de concetățenii noștri în luptele împotriva fascismului, fapt pentru care s-au învrednicit (mulți dintre ei post-mortem) de înalte distincții militare (D. Calaraș, I. Coval, Gh. Cernienco, N. Lebedenco, V, Ermurațchi, F. Rotari, S. Niculiță ș.a.).
Istoria vieții ostașilor basarabeni Gr. Odobescu, V. Reabov, D. Chiperi, E. Filatov, V. Sicorschi ș.a. simbolizează destinul dramatic al Basarabiei și al multor mii de basarabeni care prin voia sorții s-au aflat în tabere opuse, în armate dușmane, fiind puși în situația de a lupta unul împotriva altuia.
Imaginile fotografice reconstituie tabloul sinistru al distrugerilor provocate de operațiunile militare de pe teritoriul Moldovei, în special, consecințele Operației Iași - Chișinău. Ruinele din Chișinău și Bălți, Tiraspol, Iași și Constanța amintesc de grozăviile războiului și de rănile încă necicatrizate ale acelui măcel.
Intensitatea și dramatismul luptelor de lângă satul Leușeni, pe Prut, dintre armatele sovietice și germane, sunt redate pe o pânză monumentală, cu dimensiunile de 11x45 m, cu o suprafață totală de 500 mp, parte a Dioramei realizate de către renumiții pictori Nikolai Prisekin și Alexei Semionov, de la Studioul militar „M.B. Grekov" din Moscova.
Compartimentul final al expoziției prezintă un set de imagini ale unor monumente comemorative și cele 7 volume ale Cărții memoriei, publicate de Ministerul Apărării al Republicii Moldova în anii 2002-2005. Volumele conțin listele a cca. 56 mii de basarabeni recrutați în Armata Roșie și căzuți pe câmpul de luptă în perioada anilor 1944-1945.
Prin jertfa, suferința și sacrificiile a milioane de oameni, Europa a fost eliberată de sub ocupația fascistă, dar, cu regret, nu a putut fi salvată de comunism. Acolo unde a intrat tancul sovietic, a intrat și sistemul social-politic stalinist. Un regim totalitar a fost înlocuit cu un alt regim totalitar, la fel de tiranic și perfid. Regimul totalitar de tip sovietic a pus stăpânire pe țările Europei de Răsărit, inclusiv pe teritoriul dintre Prut și Nistru, lăsând în urma sa milioane de victime provocate de arestări, asasinate, foamete, deportări.